За годы работы на факультете ПМиК Бобышев В.Н. подготовил и прочитал многочисленные фундаментальные (вычислительная математика, численные методы, функциональный анализ, история математики, история науки и т.д.) и специальные курсы (разностные схемы, электронный бизнес, сетевая экономика, некорректные задачи, автоматизированные банковские системы, информационные банковские системы, численные алгоритмы метода наименьших квадратов и т.д.), вел практические и лабораторные занятия по различным дисциплинам, руководил курсовыми, дипломными и выпускными работами. Проводимые расчетно-графические, проектные и контрольные работы по курсам максимально приближены к реальным задачам.