Бобышев В.Н. руководил работой научно-исследовательского студенческого семинара СФинКС («Современные финансовые и компьютерные системы»). Под его руководством команда студентов факультета ПМиК два года успешно выступала в конкурсе кампании Майкрософт IMAGINE CUP, заняв сначала 13, а затем 9 место по России. В рамках семинара была разработана автоматизированной системы торговли на бирже, которая была установлена в брокерской конторе.   

Бобышев В.Н. длительное время являлся директором спецотделения факультета ПМиК. Была выстроена стройная система по пропаганде и подготовке приема на факультет ПМиК (дни открытых дверей, пробные экзамены, олимпиады, тестирование, викторины для учеников младших классов, кубок по поиску в Интернете и т.д.). Были организованы подготовительные курсы для абитуриентов по математике, информатике, обществоведению, русскому языку. Большинство слушателей подготовительных курсов поступало затем на факультет ПМиК.

Для студентов и других слушателей проводились многочисленные курсы по информатике, бухгалтерскому учету, различным разделам высшей математики. В рамках спецотделения предлагались дополнительные виды обучения по профессиональной переподготовке.

Доходы от деятельности спецотделения позволили премировать разработчиков лучшей в России автоматизированной системы приема документов и зачисления абитуриентов, разработанной сотрудниками и студентами факультета ПМиК.

В 2006 году в честь 35-летия ТвГУ Бобышев В.Н. организовал на ПМиК межпредметную олимпиаду по математике, информатике, русскому языку и иностранному языку. В олимпиаде приняло участие более 100 школьников.

Бобышев В.Н. является ведущим экспертом по проверке ЕГЭ по математике и ежегодно участвует в проверке работ итоговой аттестации.

Имеет благодарности ректора ТвГУ.