В период с 2006 по 2017 гг. М.Л. Логунов работает деканом филологического факультета. В 2011 году был переизбран на второй срок ученым советом филологического факультета. В 2016 году был переизбран Ученым Советом ТвГУ на один год

За время руководства М.Л. Логуновым был осуществлен переход факультета на трехступенчатую систему образования (бакалавриат, магистратура и аспирантура). При его непосредственном участии были открыты 9 магистерских программ: «Филология», «Журналистика», «Издательское дело», «Международные отношения», «Реклама и связи с общественностью», «Фундаментальная и прикладная лингвистика», «Телевидение», «Культурология», «Издательское дело». С 2013 г. осуществляется успешный набор магистров по данным направлениям.

За отчетный период М.Л. Логуновым подготовлено и опубликовано 13 научных статей, в том числе 9 в изданиях ВАК и международных сборниках. За период 2016-2017 г.г. опубликовано 2 научные статьи (1 статья в издании ВАК) М.Л. Логунов является редактором издания «Вестник ТвГУ. Серия Филология», членом редакционного совета сборника материалов научных международных конференций, проводимых в рамках международного фестиваля «Поющие письмена», (например, «Россия и славянство: диалог культур» Материалы Международной научной конференции, Тверь 2014) редактором сборников научно-практических конференций филологического факультета.

Под руководством и непосредственным участием М.Л. Логунова были организованы и проведены 28 научных и научно-практических конференций, в том числе 16 международных.

М.Л. Логунов регулярно является организатором «Дней славянской письменности и культуры» в Твери.

За отчетный период М.Л. Логунов постоянно проходил повышение квалификации как в рамках программ, проводимых на базе ТвГУ, так и в других учебных заведениях (РУДН, РГГУ и др.), о чем имеет свидетельства и дипломы. В 2012 г. М.Л. Логунов принимал участие в международном форуме российских и итальянских вузов «Образование в Италии и России» (г.Милан), где выступил с докладом.

М.Л. Логунов читал лекционные курсы, ведет практические занятия на нескольких образовательных программах филологического факультета: «Риторика» (бакалавриат, «Реклама и связи с общественностью»), «Лингвистический анализ текста» (бакалавриат, «Филология»), «Лингвистический анализ текста» (бакалавриат, «Фундаментальная и прикладная лингвистика» ), «Семантика», «Общая лексикология» , «Общая и компьютерная лексикография» (бакалавриат «Фундаментальная и прикладная лингвистика») и др. Руководит курсовыми работами и выпускными квалификационными работами ( в среднем 5 выпускных квалификационных работ за учебный год).

М.Л. Логунов является председателем ученого совета филологического факультета и членом ученого совета ТвГУ.