Работает на кафедре русского языка с 2001 года. В 2006 году защитила диссертацию по специальности 10.02.01- русский язык на соискание ученой степени кандидата филологических наук «Суффиксальное словообразование имен существительных со значением лица в западных среднерусских говорах Тверской области». С 2008 года по настоящее время работает на кафедре русского языка в должности старшего преподавателя.

За указанный срок М.Е. Щербакова читала лекции по таким учебным дисциплинам, как «Современный русский язык. Фонетика», «Современный русский язык. Словобразование», «Активные процессы в современном русском языке», «Стилистика русского языка и культура речи», «Русский язык и культура речи», «Русская диалектология», «История основного языка» и вела практические занятия по указанным дисциплинам, а также по дисциплинам «Введение в языкознание», «Практикум по орфографии и пунктуации», «Практическая грамматика».

Имеет 25 публикаций.

Принимала участие в работе над «Лингвистическим атласом русских народных говоров», проводимой Институтом лингвистических исследований РАН (г. Санкт-Петербург), а также в создании «Тематического словаря говоров Тверской области» (Тверь, 2002-2006).

Руководила рядом курсовых, дипломных и выпускных квалификационных работ студентов филологического факультета.

С 2002 по 2012 гг. выезжала в диалектологические экспедиции в различные районы Тверской области со студентами дневного отделения филологического факультета, в качестве руководителя экспедиции — в 2010 и 2012 гг.

Является экспертом ЕГЭ с 2008 года, с 2015 года — старший эксперт. В 2014 — 2016 гг. - секретарь предметной комиссии ЕГЭ по русскому языку.

Принимает активное участие в олимпиадном движении школьников. Постоянный член жюри Всероссийской олимпиады по русскому языку (муниципальный этап; региональный этап) и олимпиады «Глаголица».